Desmond Miles, olyan mint bármelyikünk a hétköznapokban. Amíg el nem rabolják...Kiderül hogy a leszármazottja egy bérgyilkos mesternek Altair-nak. Mivel javítani kell a teknikát és nem lehet akármihez hozzáférni egy előző életből így fel kell oldani minden emlékét Desmond DNS-ének és újra kell élnie mindazt ami az Assasinok kódexének lapjain láthatnánk csak.